//Если текущий статус Активен и далее нет никаких статусов в будущем пропускаем скрипт
Calendar d = Calendar.getInstance();
List statusList =  cstm.getStatusList(cid, d);
List newstatusList = new ArrayList();
for (Iterator i = statusList.iterator(); i.hasNext();) {
   ContractStatus s = (ContractStatus) i.next();
   cStatus=s.getStatus();
   // Если будущйи статус = ОТКЛЮЧЕН или Закрыт
//   if( cStatus == 2 || cStatus == 3){
      s.setStatus(0);
      s.setComment("Статус изменен скриптом 'Изменение статуса договора по приходу платежа'");
   //}
    newstatusList.add(s);
}
// Меняем статусы в соответствии с новым списком статусов
for (Iterator t = newstatusList.iterator(); t.hasNext();){
   ContractStatus s2 = (ContractStatus) t.next();
   cstm.changeStatus(s2,0,true);
}

public class setStatusContract {
    private static String db_url = "СТРОКА ПОДКЛЧЕНИЯ К БД";
    public static void main(String[] args){
        Connection con = null;
        try{
            DriverManager.registerDriver((Driver)Class.forName("com.mysql.jdbc.Driver").newInstance());
            con = DriverManager.getConnection(db_url,user,pass);
            ContractStatusManager cstm = new ContractStatusManager(con);
            int cid= КОД ДОГОВОРА;
            Calendar d = Calendar.getInstance();           
            List statusList =  cstm.getStatusList(cid, d);
            // нужно взять статус договора на дату закрытия договора
            java.util.List newstatusList = new java.util.ArrayList();
            for (java.util.Iterator i = statusList.iterator(); i.hasNext();) {
                ContractStatus s = (ContractStatus) i.next();
      s.setStatus(0);
      s.setComment("Закрываем скриптом по причине окончания срока действия договора.");   
                newstatusList.add(s);   
            }
            // Меняем статусы в соответствии с новым списком статусов
            for (java.util.Iterator t = newstatusList.iterator(); t.hasNext();){
                ContractStatus s2 = (ContractStatus) t.next();
                try{
                    cstm.changeStatus(s2,0,true); // Вот 47 строка в моем коде на которой и происходит exception
                }catch(Exception e){
                    e.printStackTrace();
                }
            }           
            con.close();
        }catch(Exception e){
            e.printStackTrace();
        }
    }
}

for (java.util.Iterator t = newstatusList.iterator(); t.hasNext();){
                ContractStatus s2 = (ContractStatus) t.next();
}

for (ContractStatus s2 : newstatusList){
}

В 4.6 сейчас есть глобальные скрипты поведения, может пригодятся...